Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGCXP38435 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGCXP38435 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGCXP38435 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGCXP38435 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGCXP38435 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGCXP38435 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGCXP38435 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGCXP38435 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGCXP38435 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGCXP38435 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGCXP38435 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGCXP38435 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGCXP38435 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGCXP38435 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGCXP38435 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGCXP38435 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGCXP38435 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGCXP38435 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGCXP38435 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGCXP38435 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GGCXP38435 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGCXP38435 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GGCXP38435 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GGCXP38435 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGCXP38435 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGCXP38435 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGCXP38435 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGCXP38435 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGCXP38435 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGCXP38435 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGCXP38435 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGCXP38435 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGCXP38435 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGCXP38435 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGCXP38435 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGCXP38435 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGCXP38435 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGCXP38435 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGCXP38435 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGCXP38435 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGCXP38435 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGCXP38435 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGCXP38435 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGCXP38435 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGCXP38435 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGCXP38435 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGCXP38435 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGCXP38435 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGCXP38435 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGCXP38435 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGCXP38435 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGCXP38435 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GGCXP38435 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGCXP38435 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGCXP38435 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms