Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP62P37198 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP62P37198 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP62P37198 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP62P37198 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP62P37198 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP62P37198 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP62P37198 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP62P37198 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP62P37198 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP62P37198 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms