Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms