Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms