Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT2P35908 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT2P35908 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT2P35908 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT2P35908 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT2P35908 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT2P35908 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT2P35908 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT2P35908 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT2P35908 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT2P35908 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT2P35908 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT2P35908 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT2P35908 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT2P35908 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT2P35908 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT2P35908 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT2P35908 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT2P35908 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT2P35908 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT2P35908 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT2P35908 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT2P35908 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT2P35908 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT2P35908 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT2P35908 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms