Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF1BP35680 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HNF1BP35680 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms