Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD12P35452 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD12P35452 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms