Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms