Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA3P32297 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA3P32297 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms