Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIPP30301 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIPP30301 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPP30301 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MIPP30301 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MIPP30301 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPP30301 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPP30301 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPP30301 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPP30301 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPP30301 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPP30301 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPP30301 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPP30301 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPP30301 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPP30301 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPP30301 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPP30301 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPP30301 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPP30301 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPP30301 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPP30301 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPP30301 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPP30301 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPP30301 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPP30301 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPP30301 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms