Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD40LGP29965 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms