Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB2P29323 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB2P29323 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB2P29323 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms