Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD1P28340 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD1P28340 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD1P28340 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD1P28340 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD1P28340 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD1P28340 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD1P28340 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD1P28340 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD1P28340 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD1P28340 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD1P28340 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD1P28340 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD1P28340 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD1P28340 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD1P28340 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD1P28340 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD1P28340 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLD1P28340 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLD1P28340 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLD1P28340 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLD1P28340 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLD1P28340 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLD1P28340 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLD1P28340 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD1P28340 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD1P28340 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD1P28340 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD1P28340 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD1P28340 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD1P28340 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD1P28340 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD1P28340 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD1P28340 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD1P28340 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD1P28340 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD1P28340 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD1P28340 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD1P28340 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD1P28340 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD1P28340 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD1P28340 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLD1P28340 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLD1P28340 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLD1P28340 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLD1P28340 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLD1P28340 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLD1P28340 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLD1P28340 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD1P28340 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD1P28340 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD1P28340 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD1P28340 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD1P28340 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD1P28340 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD1P28340 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD1P28340 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD1P28340 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms