Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PEX2P28328 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX2P28328 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX2P28328 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX2P28328 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX2P28328 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX2P28328 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX2P28328 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX2P28328 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PEX2P28328 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PEX2P28328 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX2P28328 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX2P28328 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX2P28328 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX2P28328 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX2P28328 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX2P28328 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX2P28328 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PEX2P28328 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX2P28328 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX2P28328 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX2P28328 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX2P28328 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX2P28328 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX2P28328 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PEX2P28328 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX2P28328 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX2P28328 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX2P28328 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX2P28328 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX2P28328 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX2P28328 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX2P28328 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX2P28328 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX2P28328 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX2P28328 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX2P28328 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX2P28328 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms