Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL3RAP26951 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms