Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF6P23409 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF6P23409 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF6P23409 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF6P23409 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYF6P23409 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYF6P23409 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYF6P23409 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MYF6P23409 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYF6P23409 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYF6P23409 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYF6P23409 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYF6P23409 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYF6P23409 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYF6P23409 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYF6P23409 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYF6P23409 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYF6P23409 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYF6P23409 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYF6P23409 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYF6P23409 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYF6P23409 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYF6P23409 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYF6P23409 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYF6P23409 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYF6P23409 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYF6P23409 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms