Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NF1P21359 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NF1P21359 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NF1P21359 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NF1P21359 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NF1P21359 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NF1P21359 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NF1P21359 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NF1P21359 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NF1P21359 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NF1P21359 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NF1P21359 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NF1P21359 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NF1P21359 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NF1P21359 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NF1P21359 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NF1P21359 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NF1P21359 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NF1P21359 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NF1P21359 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NF1P21359 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NF1P21359 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NF1P21359 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NF1P21359 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NF1P21359 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NF1P21359 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NF1P21359 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NF1P21359 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NF1P21359 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NF1P21359 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NF1P21359 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NF1P21359 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NF1P21359 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NF1P21359 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms