Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms