Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms