Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFE3P19532 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFE3P19532 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFE3P19532 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFE3P19532 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFE3P19532 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFE3P19532 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFE3P19532 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFE3P19532 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFE3P19532 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFE3P19532 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFE3P19532 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFE3P19532 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFE3P19532 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFE3P19532 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFE3P19532 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFE3P19532 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFE3P19532 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFE3P19532 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFE3P19532 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFE3P19532 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFE3P19532 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFE3P19532 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFE3P19532 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFE3P19532 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFE3P19532 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFE3P19532 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFE3P19532 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFE3P19532 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFE3P19532 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFE3P19532 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFE3P19532 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFE3P19532 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFE3P19532 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TFE3P19532 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFE3P19532 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFE3P19532 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFE3P19532 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFE3P19532 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFE3P19532 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFE3P19532 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFE3P19532 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFE3P19532 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFE3P19532 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TFE3P19532 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TFE3P19532 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms