Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms