Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDCP19113 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDCP19113 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDCP19113 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDCP19113 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDCP19113 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDCP19113 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDCP19113 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDCP19113 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDCP19113 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDCP19113 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDCP19113 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDCP19113 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDCP19113 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDCP19113 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDCP19113 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDCP19113 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDCP19113 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDCP19113 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDCP19113 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HDCP19113 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HDCP19113 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HDCP19113 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDCP19113 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDCP19113 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDCP19113 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms