Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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