Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
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