Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms