Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB4P16144 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGB4P16144 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms