Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA1P15085 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA1P15085 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA1P15085 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA1P15085 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA1P15085 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA1P15085 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA1P15085 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA1P15085 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA1P15085 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA1P15085 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPA1P15085 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPA1P15085 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPA1P15085 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPA1P15085 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPA1P15085 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms