Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPBP14678 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms