Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM27P14373 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms