Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XRCC5P13010 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC5P13010 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms