Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL11A1P12107 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL11A1P12107 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms