Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP2C9P11712 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP2C9P11712 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP2C9P11712 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP2C9P11712 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP2C9P11712 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms