Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1P11387 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1P11387 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1P11387 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1P11387 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1P11387 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1P11387 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP1P11387 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP1P11387 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP1P11387 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP1P11387 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP1P11387 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1P11387 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1P11387 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1P11387 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1P11387 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1P11387 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1P11387 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1P11387 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1P11387 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1P11387 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1P11387 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1P11387 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1P11387 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1P11387 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1P11387 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1P11387 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1P11387 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1P11387 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1P11387 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1P11387 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1P11387 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1P11387 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1P11387 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1P11387 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms