Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI2P10070 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GLI2P10070 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GLI2P10070 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GLI2P10070 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GLI2P10070 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI2P10070 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI2P10070 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI2P10070 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI2P10070 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI2P10070 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI2P10070 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI2P10070 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI2P10070 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI2P10070 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI2P10070 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GLI2P10070 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GLI2P10070 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GLI2P10070 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GLI2P10070 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GLI2P10070 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GLI2P10070 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GLI2P10070 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI2P10070 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI2P10070 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI2P10070 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI2P10070 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI2P10070 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI2P10070 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI2P10070 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI2P10070 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI2P10070 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GLI2P10070 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GLI2P10070 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GLI2P10070 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GLI2P10070 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GLI2P10070 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GLI2P10070 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GLI2P10070 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GLI2P10070 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GLI2P10070 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GLI2P10070 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GLI2P10070 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GLI2P10070 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GLI2P10070 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI2P10070 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GLI2P10070 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GLI2P10070 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
GLI2P10070 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GLI2P10070 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GLI2P10070 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI2P10070 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI2P10070 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI2P10070 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI2P10070 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI2P10070 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI2P10070 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI2P10070 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI2P10070 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI2P10070 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI2P10070 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI2P10070 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI2P10070 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI2P10070 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI2P10070 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI2P10070 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI2P10070 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI2P10070 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GLI2P10070 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GLI2P10070 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GLI2P10070 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GLI2P10070 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
GLI2P10070 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GLI2P10070 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GLI2P10070 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GLI2P10070 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms