Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL3O95573 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL3O95573 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms