Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX6O95475 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX6O95475 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX6O95475 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX6O95475 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX6O95475 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX6O95475 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX6O95475 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX6O95475 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIX6O95475 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIX6O95475 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX6O95475 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX6O95475 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIX6O95475 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIX6O95475 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX6O95475 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX6O95475 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX6O95475 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX6O95475 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX6O95475 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX6O95475 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX6O95475 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX6O95475 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX6O95475 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIX6O95475 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms