Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MATN4O95460 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MATN4O95460 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MATN4O95460 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MATN4O95460 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MATN4O95460 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MATN4O95460 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MATN4O95460 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MATN4O95460 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MATN4O95460 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MATN4O95460 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MATN4O95460 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MATN4O95460 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MATN4O95460 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MATN4O95460 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MATN4O95460 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MATN4O95460 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MATN4O95460 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MATN4O95460 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MATN4O95460 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MATN4O95460 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MATN4O95460 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MATN4O95460 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MATN4O95460 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MATN4O95460 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MATN4O95460 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MATN4O95460 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MATN4O95460 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MATN4O95460 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MATN4O95460 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MATN4O95460 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MATN4O95460 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MATN4O95460 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms