Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms