Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL18O94889 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms