Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCC1O94876 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC1O94876 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms