Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN5O94779 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms