Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP9O75884 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBBP9O75884 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBBP9O75884 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBBP9O75884 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP9O75884 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBBP9O75884 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms