Protein–RNA interactions for Protein: O60684

KPNA6, Importin subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA6O60684 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA6O60684 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA6O60684 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KPNA6O60684 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KPNA6O60684 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms