Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms