Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAK2O60296 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK2O60296 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms