Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX15O60248 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX15O60248 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX15O60248 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX15O60248 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX15O60248 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX15O60248 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX15O60248 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX15O60248 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOX15O60248 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOX15O60248 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX15O60248 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX15O60248 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX15O60248 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX15O60248 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX15O60248 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOX15O60248 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX15O60248 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX15O60248 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX15O60248 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX15O60248 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX15O60248 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX15O60248 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX15O60248 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms