Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP9O43818 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP9O43818 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP9O43818 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP9O43818 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP9O43818 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP9O43818 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP9O43818 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP9O43818 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP9O43818 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP9O43818 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP9O43818 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP9O43818 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP9O43818 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP9O43818 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP9O43818 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP9O43818 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP9O43818 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP9O43818 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP9O43818 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP9O43818 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP9O43818 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP9O43818 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP9O43818 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP9O43818 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP9O43818 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP9O43818 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP9O43818 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP9O43818 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP9O43818 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRP9O43818 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRP9O43818 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP9O43818 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP9O43818 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP9O43818 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP9O43818 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP9O43818 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP9O43818 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP9O43818 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP9O43818 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP9O43818 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms