Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms