Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBFA2T2O43439 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFA2T2O43439 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFA2T2O43439 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms