Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA3O43365 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms